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公司新聞

醫(yī)院檢驗(yàn)科病毒核酸檢測(cè)設(shè)備與要求


PCR實(shí)驗(yàn)室的基本設(shè)備與要求


一、?臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室區(qū)域設(shè)置原則

(一)?臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室區(qū)域設(shè)置原則

1、?試劑儲(chǔ)存和準(zhǔn)備區(qū)
2、?標(biāo)本制備區(qū)
3、?擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)
4、?擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)?如使用全自動(dòng)分析儀,區(qū)域可適當(dāng)合并。

(二)?各工作區(qū)域必須有明確的標(biāo)記,避免不同工作區(qū)域內(nèi)的設(shè)備、物品混用。

(三)?進(jìn)入各工作區(qū)域必須嚴(yán)格按照單一方向進(jìn)行?即試劑儲(chǔ)存和準(zhǔn)備區(qū)?—>標(biāo)本制備區(qū)—>擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)—>擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。

(四)?不同的工作區(qū)域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開各工作區(qū)域時(shí),不得將工作服帶出。


二、?工作區(qū)域儀器設(shè)備配置標(biāo)準(zhǔn)


(一)?試劑儲(chǔ)存和準(zhǔn)備區(qū)
1、2-8度和-15冰箱
2、混勻器
3、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)
4、移動(dòng)紫外燈(近工作臺(tái)面)
5、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)
6、用工作服和工作鞋
7、用辦公用品

(二)?標(biāo)本制備區(qū)
1、2-8C冰箱、-20C或-80C冰箱
2、高速臺(tái)式冷凍離心機(jī)
3、混允器
4、福意聯(lián)樣本滅活恒溫箱 
5、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)?? 
6、可移動(dòng)紫外燈(近工作臺(tái)面)
7、超凈工作臺(tái)
8、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)
9、用工作服和工作鞋
10、用辦公用品?,如需處理大分子DNA,應(yīng)具有超聲波水浴儀。

(三)?擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)
1、?核酸擴(kuò)增儀
2、?微量加樣器(覆蓋1-1000ul)
3、?可移動(dòng)紫外燈(近工作臺(tái)面)
4、?消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)
5、?用工作服和工作鞋
6、?用辦公用品
(四)擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)?視檢驗(yàn)方法不同而定,基本儀器設(shè)備如下:
1、?微量加樣器(覆蓋1-1000ul)
2、?可移動(dòng)紫外燈(近工作臺(tái)面)
3、?消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、加樣器吸頭(帶濾心)
4、?用工作服和工作鞋
5、?用辦公用品


臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室的規(guī)范化設(shè)置及其管理

(一)試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)

   下述操作在該區(qū)進(jìn)行:貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備。?貯存試劑和用于標(biāo)本制備的材料應(yīng)直接運(yùn)送至試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū),不能經(jīng)過(guò)產(chǎn)物分析區(qū)。在打開含有反應(yīng)混合液的離心管或試管前,應(yīng)將其快速離心數(shù)秒。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成需的貯存試劑。當(dāng)貯存試劑溶液經(jīng)檢查可用后,應(yīng)將其分裝貯存?zhèn)溆?,避免由于?jīng)常打開反應(yīng)管吸液而造成污染。

     含反應(yīng)混合液的離心管或試管在冰凍前都應(yīng)快速離心數(shù)秒。大多數(shù)用于擴(kuò)增的試劑都應(yīng)冰凍貯存。為避免因單次反應(yīng)取液而頻繁的凍融主貯存試劑,應(yīng)分裝冰凍貯存試劑溶液。貯存試劑的分裝體積根據(jù)通常在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)一次測(cè)定需的擴(kuò)增反應(yīng)數(shù)來(lái)決定。

     主反應(yīng)混合液的組成成份尤其是聚合酶的適用性和穩(wěn)定性預(yù)試驗(yàn)來(lái)檢查,評(píng)價(jià)結(jié)果必須有書面報(bào)告。對(duì)于"熱啟動(dòng)"技術(shù)(在**個(gè)高溫變性步驟后加入酶),聚合酶也可不包含在主反應(yīng)混合液中。

    在整個(gè)本區(qū)的實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中,操作者必須戴手套,并經(jīng)常更換。此外,操作中使用一次性帽子也是一個(gè)有效地防止污染的措施。

    嚴(yán)禁用嘴吸取液體,加樣器和吸頭等必須經(jīng)高壓處理。?工作結(jié)束后必須立即對(duì)工作區(qū)進(jìn)行清潔。本工作區(qū)的實(shí)驗(yàn)臺(tái)表面應(yīng)可耐受諸如次氯酸鈉的化學(xué)物質(zhì)的**清潔。實(shí)驗(yàn)臺(tái)表面的紫外照射應(yīng)方便有效。由于紫外照射的距離和能量對(duì)去污染的效果非常關(guān)鍵,因此可使用可移動(dòng)紫外燈(254nm波長(zhǎng)),在工作完成后調(diào)至實(shí)驗(yàn)臺(tái)上60~90cm內(nèi)照射。由于擴(kuò)增產(chǎn)物僅幾百bp,對(duì)紫外線損傷不敏感,因此紫外照射擴(kuò)增片段必須延長(zhǎng)照射時(shí)間,*好是照射過(guò)夜。實(shí)驗(yàn)室及其設(shè)備的使用必須有日常記錄。

(二)標(biāo)本制備區(qū)

   下述操作在該區(qū)進(jìn)行:臨床標(biāo)本的保存,核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴(kuò)增反應(yīng)管和測(cè)定RNA時(shí)cDNA的合成。?要正確使用加樣器。由于在加樣操作中可能會(huì)發(fā)生氣溶膠致的污染,以應(yīng)避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動(dòng)??稍诒緟^(qū)內(nèi)設(shè)立正壓條件避免從鄰近區(qū)進(jìn)入本區(qū)的氣溶膠污染。為避免樣本間的交叉污染,加入待測(cè)核酸后,必須蓋好含反應(yīng)混合液的反應(yīng)管。對(duì)具有潛在傳染危險(xiǎn)性的材料,必須有明確的樣本處理和滅活程序。

    用過(guò)的加樣器吸頭必須放入門的**(例如含次氯酸鈉溶液)容器內(nèi)。實(shí)驗(yàn)室桌椅表面每次工作后都要清潔,實(shí)驗(yàn)材料(原始血標(biāo)本、標(biāo)本、提取中的標(biāo)本與試劑的混合液等)如出現(xiàn)外濺,則必須分別處理并作出記錄。

    對(duì)實(shí)驗(yàn)臺(tái)適當(dāng)?shù)淖贤庹丈?254nm波長(zhǎng),與工作臺(tái)面近距離)適合于滅活去污染??梢苿?dòng)紫外線管燈可用來(lái)確保工作后對(duì)實(shí)驗(yàn)臺(tái)面的充分照射。?樣本處理對(duì)PCR實(shí)驗(yàn)室要求和基本設(shè)備核酸擴(kuò)增有很大影響,必須使用有效的核酸提取方法,可在開展臨床標(biāo)本檢測(cè)前對(duì)提取方法進(jìn)行評(píng)價(jià)。

    用于RNA擴(kuò)增檢測(cè)的樣本制備好以后,應(yīng)立即進(jìn)行cDNA合成,因?yàn)閏DNA鏈較RNA穩(wěn)定,保存相對(duì)容易。為保逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的需要,應(yīng)在標(biāo)本制備區(qū)設(shè)置一個(gè)以上的溫育裝置。

   cDNA合成的理想溫度依使用的酶而定,傾向于使用一步法:即使用在擴(kuò)增反應(yīng)緩沖液條件下具有逆轉(zhuǎn)錄活性的熱穩(wěn)定的DNA聚合酶進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,其較cDNA合成后再開蓋以調(diào)節(jié)緩沖液或加入聚合酶進(jìn)行擴(kuò)增發(fā)生污染的可能性降低。

   待測(cè)RNA的cDNA拷貝須保存在標(biāo)本制備區(qū),不得在本區(qū)對(duì)樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

(三)擴(kuò)增區(qū)

  下述工作在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行:DNA或cDNA擴(kuò)增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來(lái)自樣本制備區(qū))的加入和主反應(yīng)混合液(來(lái)自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應(yīng)混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行。在巢式PCR測(cè)定中,通常在**輪擴(kuò)增后必須打開反應(yīng)管,因此巢式擴(kuò)增有較高的污染危險(xiǎn)性,**次加樣必須在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行。?不能從本區(qū)再進(jìn)入任何"上游"區(qū)域,可降低本區(qū)的氣壓以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。?為避免氣溶膠致的污染,應(yīng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的走動(dòng)。如有加樣則應(yīng)在超凈臺(tái)內(nèi)進(jìn)行。打開預(yù)處理過(guò)的反應(yīng)混合液時(shí)必須防止液體濺出,尤其是在巢式擴(kuò)增步驟之間。一個(gè)簡(jiǎn)單的方法是在打開反應(yīng)管前快速離心數(shù)秒??墒褂皿w積較小的離心機(jī),因其占實(shí)驗(yàn)臺(tái)面小,易于用一只手操作,適合于大多數(shù)超凈臺(tái)。防潮屏障如石蠟油或輕礦物油也具有防污染,但必須注意的是,礦物油本身也可能成為一種持續(xù)性的污染源。用過(guò)的加樣器必須注意清潔**。

   完成操作及每天工作后都必須對(duì)實(shí)驗(yàn)室臺(tái)面進(jìn)行清潔和**,紫外照射方法與前面區(qū)域相同。如有溶液濺出,必須處理并作出記錄。

  (四)擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)???下述操作在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行:擴(kuò)增片段的測(cè)定。

  核酸擴(kuò)增后產(chǎn)物的分析方法多種多樣,如膜上或微孔板上探針雜交方法(同位素標(biāo)記或非同位素標(biāo)記)、瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳、Southern  轉(zhuǎn)移、核酸測(cè)序方法等。目前國(guó)內(nèi)的商品試劑盒絕大部分均采用非同位素標(biāo)記的微孔板上探針雜交方法,即PCR-ELISA方法,也有膜上探針雜交方法。?本區(qū)是*主要的擴(kuò)增產(chǎn)物污染來(lái)源,因此必須注意避免本區(qū)的物品及工作服將擴(kuò)增產(chǎn)物帶出。在使用PCR-ELISA方法檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物時(shí),必須使用洗板機(jī)洗板,廢液必須收集至1mol/L?HC1中,并且不能在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)傾倒,而應(yīng)至遠(yuǎn)離PCR實(shí)驗(yàn)室的地方棄掉。用過(guò)的吸頭也必須放至1mol/L?HCl中浸泡后再放到垃圾袋中按程序處理,如焚燒。?由于本區(qū)有可能會(huì)用到某些可致基因突變和有毒物質(zhì)如溴化乙錠、丙烯酰胺、甲醛或同位素等,故應(yīng)注意實(shí)驗(yàn)人員的防護(hù)。